plot_mean_time()
plot_mean_time()绘制了一个横向条形图,用于展示在所有序列中,每个状态所花费的平均时间。您也可以选择添加标准误差条来判断不确定性。
例如:如果您的序列涵盖10年,而个体在“教育”状态平均花费2.8年,那么“教育”状态的条形长度即为2.8(在x轴上)。时间单位(年、月、波次等)与您的数据一致。
函数用法
plot_mean_time(
seqdata,
show_error_bar=True, # 添加标准误差线(SE whiskers)
title=None, # 可选的图表标题
x_label="Mean Time (Years)", # 根据需要可改为 "Months" / "Waves"
y_label="State",
save_as=None, # 例如 "mean_time.png"
dpi=200
)输入参数
| 参数 | 是否必须参数 | 类型 | 描述 | |------------------| | ------------ | ------------------------------------------------------------------------------------------- | | seqdata | ✓ | SequenceData | 您使用 SequenceData 创建的序列数据集。 | | show_error_bar | ✗ | bool | 若为 True,则显示各状态平均时间的标准误差条。默认为 True。 | | title | ✗ | str | Figure title. Default = None (no title). 图表标题。默认为 None (无标题)。 | | x_label | ✗ | str | X轴标签。默认为 "Mean Time (Years)"。请根据您的时间单位进行修改。 | | y_label | ✗ | str | Y轴标签。默认为 "State"。 | | save_as | ✗ | str | 保存图表的文件路径 (例如 "mean_time.png")。如果省略,则仅显示图表。 | | dpi | ✗ | int | 保存时的输出分辨率。默认为 200。若用于发表,建议使用 300+。 |
功能说明
- 计算在所有序列中,每个状态所花费的平均总时间。
- 可选择为每个条形计算并绘制标准误差线(standard error whiskers)。
- 按平均时间(从小到大)对状态进行排序,使图表更易于阅读。
- 使用您
SequenceData中的颜色映射,确保状态颜色与其他图例一致。 - 在您的环境中(Notebook单元格输出或脚本窗口)显示图表,并可通过
save_as保存。
主要特点
- Intuitive “how long in each state?” summary at a glance.
- Error bars for uncertainty (toggle with
show_error_bar). - Clean defaults (light grid, readable labels) with minimal configuration.
- Publication-ready export with
save_asanddpi.
Examples示例
1. 基础平均时间图
plot_mean_time(seqdata)显示每个状态的平均时间(带标准误差条),并按平均时间对状态进行排序。
2. 自定义标签并隐藏误差条(error bars)
plot_mean_time(
seqdata,
show_error_bar=False,
x_label="Mean Time (Months)",
y_label="Life-course State",
title="Average Time Spent by State (Months)"
)3. 保存高分辨率图表
plot_mean_time(
seqdata,
save_as="mean_time_by_state.png",
dpi=300
)将 mean_time_by_state.png 保存到您当前的工作目录(或您指定的路径)。
注意事项
- 单位取决于您的数据。如果您的序列时间点是月份,请设置
x_label="Mean Time (Months)"。 - 此处的“标准误差”反映了序列间平均时间的变异性;更宽的误差条意味着更高的不确定性。
作者
代码:梁彧祺
文档:梁彧祺
编辑:梁彧祺
翻译:何梁星云